《中國中醫(yī)基礎(chǔ)醫(yī)學雜志》創(chuàng)刊于1995年，由國家中醫(yī)藥管理局主管、中國中醫(yī)科學院中醫(yī)基礎(chǔ)理論研究所主辦，是國內(nèi)目前唯一一本中醫(yī)基礎(chǔ)類專業(yè)刊物。

《中國中醫(yī)基礎(chǔ)醫(yī)學雜志》主要發(fā)表國家自然科學基金、國家社會科學基金、國家中醫(yī)藥管理局科研基金、各省市區(qū)及單位的科研基金項目文章。根據(jù)學術(shù)研究熱點、、焦點和發(fā)展趨勢，堅持立足中醫(yī)基礎(chǔ)理論，兼顧臨床基礎(chǔ)研究，理論研究與實驗研究相結(jié)合，基礎(chǔ)研究與應(yīng)用研究相結(jié)合的辦刊方向，以理論探討、實驗研究和臨床基礎(chǔ)為主，發(fā)表以中醫(yī)基礎(chǔ)理論研究為主的文章。重點欄目有：理論探討、中醫(yī)方法學、實驗研究、中醫(yī)多學科研究、臨床基礎(chǔ)、針灸研究、方藥研究、臨證驗案、述評。

創(chuàng)刊以來，本刊成為北大中文核心期刊（中國醫(yī)學類）、中國科技核心期刊、中國科學引文數(shù)據(jù)庫CSCD來源期刊、中國生物學文摘和文獻數(shù)據(jù)庫核心期刊、中國學術(shù)期刊光盤版核心期刊，被中國學術(shù)期刊數(shù)據(jù)庫、中國科技期刊數(shù)據(jù)庫、CA化學文摘(美)、JST日本科學技術(shù)振興機構(gòu)數(shù)據(jù)庫(日)等數(shù)據(jù)庫收錄，在國內(nèi)外中醫(yī)基礎(chǔ)研究方面具有重要的影響。現(xiàn)任名譽主編為王永炎院士，主編孟慶云，現(xiàn)任社長兼執(zhí)行主編徐世杰，副主編曹洪欣、呂愛平、潘桂娟、胡鏡清。